Jean-Christophe Muller est magistrat du ministère public depuis 1994. Il a depuis occupé toutes les fonctions du parquet et notamment celles de procureur de la République durant treize ans. Il a été également membre du cabinet du garde des Sceaux de 2002 à 2005, où il était chargé de la législation pénale et des affaires criminelles. Depuis 2017, Jean-Christophe Muller est avocat général à la cour d’assises de Paris.